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2009: Brand New Eyes 

En enero de 2009, Josh Farro habló sobre el que sería el próximo álbum de la banda. Hablando con Kerrang!, Farro dijo: "Vamos a tratar de grabarlo en Nashville. Creo que escribir el álbum ahí nos inspirará, y luego si grabamos allí también será mucho más fácil, ya que podemos dormir en la cama por la noche y no en hoteles como los demás 300 días del año! No estamos seguros aun de como será el álbum. Hicimos "Decode" con el productor Rob Cavallo, que fue una buena experiencia, pero estamos mirando a su alrededor y no quieren tomar ninguna decisión hasta que tengamos un montón de canciones y sabemos lo que estamos buscando. Disfrutamos mucho con nuestro sonido en vivo y queremos un productor que realmente pueda captar eso ".
El 21 de enero de 2009, se anunció que Paramore sería el invitado especial junto con Bedouin Soundclash, The Sounds y Janelle Monae en el tour de la banda No Doubt, el "No Doubt Summer Tour 2009", que se iniciaría en mayo en anfiteatros y espacios al aire libre en los EE.UU. y Canadá.
El 15 de junio de 2009, Paramore anunció que Taylor York se había convertido oficialmente en un miembro de la banda.
Posteriormente grabaron una presentación acústica, MTV Unplugged, y que se puede ver en el sitio web de MTV.
Tras terminar de componer y grabar su tercer álbum titulado Brand New Eyes, el 7 de julio lanzaron el primer single "Ignorance", mientras que el video fue estrenado el 13 de agosto. El álbum fue lanzado el 29 de septiembre de 2009 y debutó en el nº 2 de US Billboard 200 vendiendo 175.000 copias en su primera semana. Más tarde, en su sitio web, la banda anunció que iniciaría una gira por los Estados Unidos que comenzaría el 29 de septiembre (coincidiendo con el día del lanzamiento de Brand New Eyes) y que terminaría el 1 de noviembre en su ciudad natal. Sin embargo, durante su primera presentación para promocionar el álbum, Hayley Williams debió abandonar el escenario debido a problemas con su garganta. El 2 de octubre la banda debió posponer alguna fechas debido a que Williams había enfermado de laringitis.
En este año la banda se presentará en el Australian Soundwave Festival con otras bandas como Faith No More, Placebo, My Chemical Romance, Jimmy Eat World y Taking Back Sunday.
Este año (2010) Josh Farro anuncio que se tomaría un receso de la banda para organizar su boda con su novia Jenna Rice, siendo el hermano de Taylor, Justin York, quien lo sustituirá durante la gira.

Lista de Canciones
1. Careful.
2. Ignorance.
3. Playing God.
4. Brick by Boring Brick.
5. Turn It Off.
6. The Only Exception.
7. Feeling Sorry.
8. Looking Up.
9. Where the Lines Overlap.
10. Misguided Ghosts.
11. All I Wanted.